ccdc是什么的缩写
发布时间:2025-05-20 02:10:27 发布人:远客网络
一、ccdc是什么的缩写
1、ccdc,全称为Cambridge Crystallographic Data Centre,中文译作剑桥晶体数据库中心,成立于1965年的剑桥大学。该中心专注于收集、管理和传播晶体学数据,其目标在于促进科学研究的进步,尤其是在材料科学、药物化学等领域。
2、至今,ccdc已经积累了超过一百万个晶体结构数据,这些数据从简单的分子结构到复杂的蛋白质结构应有尽有。这些详尽的数据资源不仅能够帮助科学家们深入理解物质的微观结构及其性质,还为新物质、新材料乃至新药物的研发提供了宝贵的参考依据。
3、除此之外,ccdc还为研究人员提供了多样化的工具和软件,这些工具和软件能够帮助用户高效地分析和可视化晶体结构数据。通过这些先进的工具,研究人员能够更直观地理解晶体结构,加速科学发现的过程。
4、ccdc不仅仅是一个数据存储库,它还致力于推动晶体学研究与其他学科的交叉融合,鼓励跨学科合作,共同推动科学的发展。这一宗旨使得ccdc成为了全球范围内知名的晶体学研究机构。
5、总之,ccdc通过其庞大的数据资源和先进的研究工具,极大地推动了晶体学乃至整个科学界的进步,成为了一个不可或缺的研究平台。
二、【收藏】21个免费的谱图数据库
以下是21个免费谱图数据库的详细信息:
该数据库由上海有机所创建,包含多个数据库,如化合物结构、核磁谱图、质谱谱图、红外谱图、物理性质、农药、中药、植物化学、药品、化学品安全技术说明书、环境化学等,注册后可免费使用。
2.中科院长春应用化学研究所应用化学数据库地址
该数据库包含稀土萃取、物理化学性质、碳-13 NMR、化合物活性等数据,由中科院长春应用化学研究所建设。
整合中国科学院所有数据库资源,覆盖有机所、过程所、长春应化所等。
4.化合物图谱数据库查询系统地址
该系统提供化合物的红外、紫外、质谱及核磁等各种谱图及分子结构查询,包含大约10万张谱图,已有320个化合物的标准红外图。
5. Spectral Database for Organic Compounds(SDBS)地址
日本国家先进工业科学技术研究所创建的综合有机化合物光谱数据库,包含7种不同类型的光谱图,免费开放,截止2019年收录谱图数目。
提供化合物信息,如命名、结构、基本性质、毒性、谱学、鉴定方法、专利、生物活性、化学反应、医药农药应用、天然产物、相关文献和市场供应等。
7. Spectra Online,Galactic(红外谱图)地址
注册FTIR search. com账号,可访问71,000FTIR和16,000个Raman谱图,由Thermo Fisher Scientific研究所编撰。
8. NIST的Chemistry Web Book地址
NIST基于Web的物性数据库,可通过分子式、化学名、CAS登录号等检索数据,包含气相热化学数据、浓缩相热化学数据、相变数据、反应热化学数据等。
9. NIST/EPA/NIH Mass Spectral Library地址
包含147,198个化合物的波谱数据,是世界广泛使用的质谱参考数据库。
10. Organic compounds Database<a href="" title="地址" target="_blank">地址
由哈佛大学弗吉尼亚研究所编撰,包含2483个化合物,可搜索红外、物理性质、核磁、质谱、紫外等。
11.中国国家科学数字图书馆化学学科信息门户地址
提供波谱网站信息,包括国内和国外免费及部分免费的网站。
12.北京微量化学研究所分析中心<a href="" title="地址" target="_blank">地址
拥有13万3仟多张Sadtler红外光谱数据库,包括化合物标准红外光谱、农业化学、粘合剂等类别。
用于化合物结构和反应式的绘制,具备预测结合物的C/H核磁谱图的功能。
能够预测氢谱、碳谱、HSQC和杂核谱,预测准确性高,可模拟峰形。
15. NMR谱图数据库及NMR谱图预测<a href="" title="地址" target="_blank">地址
基于Spinus的NMR预测器,可以从化学结构预测光谱。
16. BioMagResBank(BMRB)<a href="" title="地址" target="_blank">地址
存储肽、蛋白质、核酸等NMR数据的数据库,与蛋白质数据库和核酸数据库合作。
17.粉末粒度模式数据库PowBase<a href="" title="地址" target="_blank">地址
包含恒定波长粉末图案的最小数据库,支持CIF文件或.dat文件查看。
19.美国标准与技术研究院NIST原子光谱数据库(ASD)<a href="" title="地址" target="_blank">地址
包含辐射数据原子和原子离子的跃迁和能级,涉及99个元素。
20.剑桥晶体数据中心(CCDC)<a href="" title="地址" target="_blank">地址
管理包含C-H键的小分子晶体结构数据的CSD数据库,处理的分子原子总数不超过500,包含无机物和大分子晶体数据库。
收录1912年至今的中国文献,包括学术期刊、学位论文、重要会议论文、年鉴、专著等。
三、剑桥晶体数据库助力药物研发
1、剑桥晶体数据库(Cambridge Structural Database, CSD)是科研界珍藏的专业资源库,记录了广泛的有机与金属有机化合物的晶体结构数据。这些数据涵盖了原子坐标、空间群属性、化学键的长度与角度等信息,对化学、材料科学、生物化学和药学研究领域贡献深远。
2、ConQuest软件,由剑桥晶体结构数据中心(Cambridge Crystallographic Data Centre, CCDC)推出,是一个高效的数据库查询工具。它能轻松检索和分析来自CSD的晶体结构信息,极大地助力了科研人员的工作。
3、本文将深入探讨宇部兴产与参天制药公司研究团队如何运用ConQuest软件在药物研发领域取得创新性突破。特别是,他们利用该软件在确定小分子药物的优势构象,开发新型选择性EP2受体激动剂方面,取得了显著成果。这种激动剂在降低眼内压方面展现出了巨大潜力,不仅凸显了ConQuest软件的高级功能,而且强调了CSD资源在推动医药研究与开发创新中的关键作用。
4、在应用案例中,研究团队利用ConQuest软件在药物设计中发挥了重要作用,尤其是在设计选择性非前列腺素类EP2受体激动剂方面。他们以CP-533,536作为初始核心结构,通过软件确定了苯氧基乙酸部分的最佳扭转角度及优势构象,从而设计了一系列新化合物,并验证了作为前药的化合物OMDI。目前,OMDI已被视为治疗青光眼的临床候选药物。
5、研究团队在开发EP2受体激动剂时,考虑到了前列腺素E2(PGE2)通过EP受体四种亚型在多种生物过程中起的关键作用。拉坦前列腺素(latanoprost)被用于降低眼内压和治疗青光眼,但其副作用限制了其应用。而布他前列素等特异性激动EP2受体的化合物显示了有效降低IOP的潜力。因此,研究团队致力于开发具有高活性和高选择性的EP2受体激动剂。
6、研究团队首先选定化合物CP-533,536作为研究出发点,该结构具有选择性EP2受体激动剂的潜力,并在促进骨折愈合的临床试验中显示了潜在的安全性。CP-533,536包含磺酰胺基团,允许对苯氧基乙酸、3-磺酰基吡啶和叔丁基苯基等部分进行独立调整。研究团队分阶段改进了其结构,通过药物化学和逆合成策略,成功发现了作为前药的化合物OMDI,这一化合物现已成为治疗青光眼的临床候选药物。
7、ConQuest软件在寻找高活性新子结构中发挥了关键作用。研究团队通过统计分析确定了化合物CP-533,536中苯氧基乙酸部分的主要构象,设计了新型苯并呋喃-2-羧酸衍生物,这些化合物显示出良好的体外活性。然而,这类结构具有较高的刚性和较低的溶解度。因此,研究团队将苯氧基乙酸部分的苯氧基替换为氨基吡啶基,发现了具有更高EP2受体激动活性的化合物13aa。
8、ConQuest软件的使用不仅限于药物设计。它让研究人员能够有效地利用CSD中超过一百万个结构的资源,支持药物化学、材料科学等多个领域的创新研究。通过深度分析和优化分子结构,ConQuest为创新药物的设计和发现提供了强大动力。正如本研究所展现的,ConQuest的应用帮助研究团队开发出了有潜力的降眼压药物,为青光眼治疗提供了新方案。
9、总之,ConQuest软件作为CSD信息检索的先进工具,以其出色的灵活性和精确度,赋能研究人员进行深入分析和优化分子结构。借助其先进的3D几何搜索技术,ConQuest不仅揭示了复杂的化学结构背后的奥秘,还能精准识别构象偏好,为药物研发提供了强有力的支持。通过与CSD资源的结合,ConQuest为科学家们提供了一个强大的平台,推动了医药研究与开发的创新。