肿瘤免疫火得飞起,更新后的TIMER 2.0数据库真心好用!

一、肿瘤免疫火得飞起,更新后的TIMER 2.0数据库真心好用!

在肿瘤研究领域，免疫细胞在微环境中的作用日益受到重视，TIMER 2.0数据库作为一款强大的工具，其更新后的功能无疑为理解肿瘤免疫相互作用提供了新视角。该数据库由哈佛大学和四川大学的研究团队开发，发表于2020年，并在Nucleic Acids Research杂志上获得了广泛认可，截至2021年，引用次数已达74次。

TIMER 2.0的改进版包含六个先进算法，它能够为TCGA数据或用户自定义的肿瘤数据提供更精确的免疫浸润水平评估。数据库共分为三个模块：免疫关联、癌症探索和免疫估计，分别用于探究免疫浸润与基因、突变、拷贝数变异和临床结局的关系，以及在TCGA队列中的癌症相关性分析。每个模块生成的功能性热图表，让用户能直观地发现不同癌症类型的关联特征。

值得注意的是，由于批处理校正样本的差异，TIMER 2.0的估计结果可能与之前版本有所不同。在Immune Association部分，数据库提供了基因、突变、sCNA和结局四个维度的分析，每个维度都有清晰的解释和操作步骤。例如，通过查看A1BG在T cell CD8+中的表现，用户能快速找到相关基因与癌种的显著关联。

Cancer Exploration模块则包括基因差异表达、基因结局、突变相关性和基因相关性分析，用户可以直观地看到基因在不同癌种中的表达变化和突变状态的影响。而Immune Estimation则允许用户上传数据，进行个性化的免疫浸润评估，同时展示了与多个免疫评估工具的比较结果。

总的来说，TIMER 2.0凭借其全面的分析和可视化功能，为肿瘤免疫学研究者提供了强大的分析工具，是深入理解肿瘤免疫动态和评估免疫治疗潜力的重要资源。无论是科研人员还是临床医生，都可以从中获得宝贵的数据支持和见解。

二、肿瘤免疫浸润网页timer2.0的结果图如何解释

肿瘤免疫浸润分析工具 TIMER2.0提供了一种深入探索癌症类型免疫浸润的途径。该工具通过综合资源展示了不同癌症类型的免疫浸润状况，提供多种免疫反褶积方法来估计免疫浸润的丰度，并支持用户生成高质量图形，以便全面探讨肿瘤免疫、临床和基因组特征。

TIMER2.0主要包含以下几个板块，帮助研究人员和医生从不同角度理解癌症与免疫系统之间的相互作用。

首先，基因（Gene）板块允许用户探索特定基因表达与免疫浸润之间的关联。例如，以 EGFR基因为例，用户可以在肺腺癌等不同癌症类型中分析其与免疫浸润的关系。结果通过图形直观展示，帮助揭示基因表达和免疫浸润之间的潜在联系。

其次，生存（Survival）板块则关注临床结果与免疫浸润或基因表达之间的关联。通过输入癌症类型和基因，可以评估特定基因表达水平或相关免疫细胞浸润与患者生存率的关系，从而为临床决策提供重要信息。

接着，突变（Mutation）板块探索特定突变基因与免疫浸润之间的关系。用户可以指定癌症类型和突变基因，进而评估突变与免疫浸润之间的关联性。

接着是体细胞拷贝数变异（SCNA）板块，此板块关注体细胞拷贝数变异与免疫浸润丰度之间的关联。输入癌症类型和基因后，系统将生成结果，揭示特定变异与免疫浸润的关系。

然后是差异基因表达（Diff Exp）板块，用于探讨肿瘤组织与正常组织之间的基因表达差异。输入感兴趣的基因，系统将显示其在 TCGA数据库中所有癌症组织和正常组织中的表达差异，为理解基因在不同状态下的作用提供依据。

紧接着是相关性（Correlation）板块，允许用户探索基因之间的相关性。选择肿瘤类型并输入两个基因，系统将计算并显示其相关性，帮助识别潜在的生物标志物或治疗靶点。

最后是评估（Estimation）板块，用户可以输入实验获得的基因表达数据，选择癌症样本，进而计算免疫基因评分。该板块提供了将私有样本纳入分析的途径，增强了工具的实用性和灵活性。

TIMER2.0的网址是：cistrome.shinyapps.io/t...。最新版本为 TIMER 2.0，其数据图生成更丰富，样本量也进行了更新，为癌症研究提供了更全面的资源。

相关文献引用包括 Taiwen Li等人的工作，强调了 TIMER作为癌症免疫研究工具的重要性，以及 Bo Li等人在 Genome Biology上发表的论文，详细介绍了肿瘤免疫综合分析的潜在临床应用。

三、NET中的三种Timer的区别和用法

在.NET1.1里面，第3个System.Timers.Timer，也是可以拖拽使用，而.NET2.0开始取消了，只能手动编写代码。而后2个没有限制制。操作方法如下：

1、首先使用RadTileList控件，TileRows="3"三行，SelectionMode="Multiple"多选。

2、前台添加一个块状元素，鼠标移动到块状元素显示另一张图片。

4、接着EnableDragAndDrop="true"添加第二个块元素，并使块元素可拖拽。

5、最后运行程序看看生成的页面。