dmpkadme是什么

一、dmpk/adme是什么

DMPK/ADME在药物研究领域中扮演着至关重要的角色，它们分别代表药物代谢和药物动力学（DMPK）以及药物的吸收、分布、代谢和排泄（ADME）。DMPK关注药物在体内的吸收、分布、代谢和排泄过程，对评估新药的药效和安全性至关重要。ADME特性由药物的结构决定，对预测药物的生物利用度和生物活性具有重要参考价值，是药物研发的关键步骤。综合DMPK和ADME的研究，能够确保药物在体内的有效性和安全性。

了解药物如何在体内被吸收、分布、代谢和排泄，是确保药物安全性和有效性的基础。以下是几个重要数据库，帮助药物研究人员获取所需数据：

1. DrugBank：包含药物的基本信息、ADME属性、药物相互作用、靶标信息及作用机制，确保信息准确可靠，是药物研究者的宝贵资源。

2. MolAid：提供精确的数据信息，包括物化性质、ADME性质、毒理性、反应、文献、晶体、谱图、安全等，支持合成实验全场景覆盖。

3. ChEMBL：包含生物活性分子数据，用户可以通过查询药物的ADME信息，包括吸收、分布、代谢和排泄数据，以及生物测定结果，是药物发现的重要资源。

4. BindingDB：专注于药物靶点结合数据，提供药物的亲和力信息，帮助理解药物如何在体内分布和发挥作用，对于药物设计和筛选具有重要意义。

5. PharmGKB：专注于药物遗传学和药物反应多态性，提供遗传信息，理解遗传因素如何影响个体对药物的反应，对个性化医疗和精准医疗至关重要。

6. ADMET Predictor：提供强大的软件工具，预测药物的ADME/T属性，包括吸收、分布、代谢、消除和毒性，为研究者在药物开发早期阶段评估候选分子提供支持。

7. SwissADME：提供预测药物ADME属性的免费Web服务，预测药物在人体内的吸收、分布、代谢和排泄过程，并评估潜在的毒性和安全性。

8. ADMETlab 3.0：由DMPNN框架训练的高质量预测模型，提供21种物理化学性质、19种药物化学性质、34个ADME终点、36个毒性终点和8个毒理学规则的计算和预测，辅助药物设计和筛选过程。

使用这些数据库和工具，研究人员可以获取关于特定化合物的详细ADME信息。以MolAid数据库为例，首先在首页搜索关键词，得到结果页后点击“物质信息”进入详情页，然后点击“ADME”查看化合物在不同环境条件下的详细信息。通过这些资源，研究人员能够深入理解药物的体内行为，推动药物研发进程。

二、药学领域的免费数据库

1、TCMSP——中药系统药理学数据库与分析平台

TCMSP是独特的中草药系统药理平台，提供药物、靶标和疾病之间的关系。数据库包括中国药典中的499种中药，29384种成分，3311种靶点，837种相关疾病。信息涵盖活性成分鉴定、化合物与药物目标网络、相关药物靶点疾病的网络等。提供化合物的药代动力学信息，如药物相似性、生物利用度、人体吸收、血脑屏障穿透、肠上皮通透性等参数，帮助选择具有良好药物特性的化合物进行深入研究。

TCMID提供中药复方、草药、草药化合物、疾病和西药的信息，通过集成数据库和文本挖掘构建。中药复方、草药和成分信息由文本挖掘收集和整合，疾病及其相关基因信息来自DrugBank和OMIM。提供全面的中药研究数据，支持深入的草药分子机制分析。

这是目前最大的非商业性中医药数据库，包含352种不同草药、动物产品和矿物质的成分，共有37170种中药化合物。用户可按化学名称、中药名称、分子性质和分子结构等标准检索。

4、CancerHSP——系统药理学抗癌草药数据库

CancerHSP包含2439种抗癌中草药和3575种抗癌成分，提供每种成分的分子结构与9个重要ADME参数信息，以及492种不同肿瘤细胞系的化合物抗癌活性数据。预测或文献收集832个化合物的靶标，有助于抗癌天然产物的分子机制研究和抗癌药物开发。

NPACT是一个人工注释的植物衍生化合物数据库，收集了1574个具有抗癌活性的植物化合物，针对353个癌细胞系和284个癌症相关蛋白靶点，提供化合物结构、性质、癌症类型、细胞系、抑制值、分子靶标、商业供应商和药物相似性信息。

6、Natural Product Activity and Species Source/ NPASS

NPASS数据库提供了天然产物的物种来源和生物活性信息，收录了35032种化合物，来自25041个物种，包括植物、细菌、后生动物、真菌等。数据库包含5863个靶标，其中2946个为蛋白靶标，涵盖多种生物活性类型。

TCM-Mesh数据库包含草药、化合物、基因、疾病、基因与疾病相互作用、基因互作信息、副反应和毒性记录，提供中药的分子机制研究支持。

CHMIS-C是抗肿瘤草药配方和成分数据库，收录了200多种抗肿瘤草药配方、900种成分、8500种有机小分子，集成的web搜索工具提高数据挖掘效率。

1、TTD——Therapeutic Target Database

TTD数据库提供药物与靶标的相关信息，包括与靶标直接相互作用的蛋白、专利和文献中的专利治疗药物及其靶标、COVID-19候选药物信息。

DrugBank提供西药分子及其机制的全面信息，包括化学、药理、ADME、相互作用和靶标信息。包含10971种药物和4900个蛋白质靶标，是中药靶点预测和阳性对照的重要资源。

ChEMBL是一个生物活性数据库，收集文献中靶点及化合物的数据，为药物化学家提供查询靶点或化合物生物活性的平台。包含近200万个化合物和13万个靶标，数据可靠且可溯源。

4、CVDSP——心血管疾病系统药理学数据库

CVDSP数据库提供心血管药理学信息，包含254种心血管药物、206种心血管治疗靶标、268个心血管疾病基因、98种心血管症状，支持药物-靶标、基因-疾病和靶标-基因关系网络的探索。

PreDC数据库包含1571种已知药物组合，从DCDB、TTD和文献收集，以及8686个高可信度预测药物组合，支持药物组合的预测和实验验证。

PharmMapper是一个在线平台，使用药效团映射方法识别潜在靶标，支持已知探针小分子的靶标识别，具有高通量能力。

PDTD数据库包含超过1100个蛋白条目，覆盖830种已知或潜在药物靶标，包括蛋白和活性位点结构、相关疾病、生物学功能和信号调控通路信息。

STITCH数据库包含43万个小分子与9643763个蛋白之间的相互作用，提供相互作用的概率或结合亲和力评分，支持化合物靶标预测。

SciFinder是化学文摘服务社自主研发的数据库，包含药物化学成分、结构和相关文献专利信息。

Pubchem是有机小分子生物活性数据库，由NIH支持，包含3个子数据库：BioAssay、Compound、Substance，用于存储生化实验数据、化合物化学结构和原始数据。

MMDB是一个三维生物分子结构数据库，基于X射线晶体衍射和NMR色谱分析，提供生物分子的三维结构信息。

UniProt是整合蛋白序列、功能信息、研究论文索引的数据库，由多个资源整合而成，包括高质量的手工注释数据库Swiss-Prot和自动翻译的数据库TrEMBL。